Помимо самих рыбок в аквариуме часто заводят ещё и беспозвоночных. Они являются хорошими фильтраторами воды. Часто поедают остатки корма, выгнившие растения, экскременты рыб. Это очень важно, потому что таким образом они являются естественными санитарами "водоёма", что максимально делает аквариумные условия соответствующими природным.

    Чаще всего аквариумисты делают выбор в пользу моллюсков. Они снижают жёсткость воды (поглощают кальций, необходимый им для строительства раковин).

    Самые распространённые моллюски: катушки, физы, мелании, ампулярии и др.

    Простейшие тоже одна из групп живых организмов, которая может населять ваш аквариум. Это различного рода инфузории и амёбы. Они так же являются фильтраторами (а амёбы даже занимаются переработкой остатков органики) тем самым они играют не последнюю роль в биологическом равновесии.

    Но другие обитатели аквариума могут приносить не только пользу. Некоторые из кишечнополостных попадают в ваше домашнее озеро самостоятельно, различными путями. Они наносят вред вашим рыбкам и водорослям. Например, стрекательные клетки гидры наносят травмы рыбам. Рыбья пиявка присасывается к коже водных обитателей и является паразитом. Прозрачный червь планария поедает в аквариуме корм, который необходим рыбам, тем самым является их конкурентом.